移転価格調査が行われる場合、調査官は法人税の確定申告書に添付された「国外関連者に関する明細書（別表十七（四））」や有価証券報告書などの公表情報を事前に入手し、課税を行うことを前提に入念な下調べをしています。事前に移転価格文書の作成を行っていない場合や、行っていても不十分である場合は、推定課税やシークレットコンパラブルによる課税を避けられたとしても、移転価格調査の対応が後手に回り十分な反論ができないまま課税をされて移転価格調査が終結してしまう可能性があります。移転価格文書を作成し、移転価格の妥当性、合理性を主張することは高額な移転価格課税を避けるため極めて重要なプロセスになります。